День добрый.
Это зависит от качества работ. При аккуратном и профессиональном исполнении - проблем не возникнет; тем более - отверстия от саморезов со стороны пара закрыты рейкой или профилем, который плотно прилегает к пароизоляции. Ветровой нагрузки на пароизоляцию практически нет, поэтому материал не "треплет" и отверстия не деформируются (ведь пароизоляция - внутри дома). Но бывает и такое, что при вкручивании самореза умудряются плёнку разворотить. Тогда, разумеется, пароизоляция перестаёт таковой являться.
Что могу посоветовать: в нашем ассортименте есть Самоклеющаяся уплотнительная лента
http://isospan.gexa.ru/produktsiya/2011-08-05-12-35-04 . Благодаря своей эластичности она затягивает отверстия вокруг самореза, плотно обжимая его - чем герметизирует поверхность. Можете пустить эту ленту под рейкой (профилем), и не беспокоиться за целостность пароизоляции.